Todas las instalaciones de NAEKO son recinto aduanero, NAEKO LOGÍSTICS en dependencia de la aduana ES000841-Barcelona-Carretera (trafico terrestre y marítimo), NAEKO HANDLING en dependencia de la aduana ES000801-Barcelona-Aeropuerto, y NAEKO HANDLING MADRID en dependencia de la aduana ES002801-Madrid-Aeropuerto.
Todas las empresas del grupo NAEKO disponen de autorizaciones aduaneras en regímenes de ADT (Almacén de Depósito Temporal), Autorización como receptor – expedidor de tránsitos y LAME (Local Autorizado para Mercancías de Exportación).
NAEKO LOGISTICS además de las citadas autorizaciones, dispone de DAP (Depósito Aduanero Público), y depósito fiscal para mercancías en régimen suspensivo de IVA (DDA - depósito distinto al Aduanero). En todos los casos disponen de conexión telemática con la AEAT para los diferentes tipos de mensajes EDIFACT y los recintos que dependen de las Aduanas aéreas tienen creación de sumarias por MAWB-HAWB.
